Planta Bioinformática Capstone | La red universitaria

Descripción

Los últimos 15 años han sido emocionantes en biología vegetal. Se han secuenciado cientos de genomas de plantas, RNA-seq ha permitido el perfil de expresión de todo el transcriptoma, y una proliferación de métodos basados en "-seq" ha permitido determinar las interacciones proteína-proteína y proteína-ADN a bajo costo y en un alto rendimiento conducta. Estos conjuntos de datos a su vez nos permiten generar hipótesis con el clic de un mouse o el toque de un dedo.

En Plant Bioinformatics en Coursera.org, cubrimos 33 herramientas en línea específicas de la planta, desde navegadores de genomas hasta minería de datos transcriptómica, análisis de promotores / redes y otros, y en este Plant Bioinformatics Capstone usaremos estas herramientas para hipotetizar un papel biológico para un gen de función desconocida, resumido en un informe de laboratorio escrito.

Este curso es parte de una Especialización en Bioinformática de Plantas en Coursera, que presenta competencias y recursos bioinformáticos centrales, como Genbank, Blast de NCBI, alineaciones de secuencias múltiples, filogenética en Métodos Bioinformáticos I, seguido de interacciones proteína-proteína, bioinformática estructural y RNA-seq análisis en Bioinformatic Methods II, además de los conceptos y herramientas específicos de la planta introducidos en Plant Bioinformatics y Plant Bioinformatics Capstone.

Este curso / capstone fue desarrollado con fondos del Fondo de Iniciativa del Curso Abierto de la Facultad de Artes y Ciencias de la Universidad de Toronto (OCIF) y fue implementado por Eddi Esteban, Will Heikoop y Nicholas Provart. Asher Pasha programó un aleatorizador de identificación de genes.