Ciencia de datos genómicos y agrupamiento (Bioinformática V)

Descripción

¿Cómo inferimos qué genes organizan diversos procesos en la célula? ¿Cómo emigraron los humanos de África y se extendieron por todo el mundo? En esta clase, veremos que estas dos preguntas aparentemente diferentes pueden abordarse utilizando técnicas algorítmicas y de aprendizaje automático similares que surgen del problema general de dividir puntos de datos en grupos distintos.

En la primera mitad del curso, presentaremos algoritmos para agrupar un grupo de objetos en una colección de grupos basados en su similitud, un problema clásico en la ciencia de datos, y veremos cómo estos algoritmos pueden aplicarse a los datos de expresión génica.

En la segunda mitad del curso, presentaremos otra herramienta clásica en ciencia de datos llamada análisis de componentes principales que se puede utilizar para preprocesar datos multidimensionales antes de agruparlos en un esfuerzo por reducir en gran medida las dimensiones del número sin perder gran parte de la "señal" en el datos.

Finalmente, aprenderá cómo aplicar herramientas populares de software de bioinformática para resolver un problema real en la agrupación.