Metagenómica aplicada a la vigilancia de patógenos y resistencia antimicrobiana

Descripción

El campo de la metagenómica y la secuenciación de toda la comunidad es un área prometedora para desentrañar el contenido de las comunidades microbianas y su relación con las enfermedades y la resistencia a los antimicrobianos en la población humana. Las herramientas bioinformáticas son extremadamente importantes para dar sentido a los datos metagenómicos, al estimar la presencia de patógenos y determinantes de resistencia a los antimicrobianos en muestras complejas. Combinado con datos explicativos relevantes, la metagenómica es una herramienta poderosa para la vigilancia.

En este curso, enseñamos sobre el potencial de la metagenómica para la vigilancia y brindamos a los alumnos una visión general de los pasos y consideraciones en un estudio de metagenómica. Después de este curso, los alumnos sabrán:

- la diferencia entre los conceptos de metagenómica y otra genómica microbiana
- la necesidad de usar controles en diferentes pasos de un estudio de metagenómica
- las ventajas de la metagenómica para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos
- cómo el diseño de la muestra, el tamaño de la muestra, el material de la muestra y el manejo de la muestra influyen en el resultado de un estudio de metagenómica
- procesamiento de muestras para metagenómica bacteriana y viral
- diferentes plataformas de secuenciación y sus posibilidades con respecto a la metagenómica
- los pasos involucrados en un estudio general de metagenómica, incluyendo control de calidad, mapeo a diferentes bases de datos y análisis de recuento de lecturas
- los principios detrás de varias herramientas disponibles para el análisis de datos de metagenómica
- cómo interpretar los resultados de clasificación de lectura
- la necesidad de epidemiología en la vigilancia
- el concepto de vigilancia global e integrada
- los desafíos para el uso de la metagenómica en la vigilancia
- el potencial de la metagenómica para la vigilancia

Esperamos darle la bienvenida !